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BIOFILM mixte de LACTOCOCCUS LACTIS (coques jaunes) et de LISTERIA MONOCYTOGENES (bâtonnets roses), observé en microscopie électronique à balayage.. © inra, Thierry MEYLHEUC

1) Objectifs et enjeux du métaprogramme MEM

Mis à jour le 30/06/2017
Publié le 19/01/2013

Le métaprogramme MEM a pour finalité d’étudier, caractériser, modéliser, estimer la diversité génétique d’écosystèmes microbiens encore peu connus, de manière à prédire, contrôler ou modifier leur fonctionnement. Le périmètre du programme comprend : les agro-systèmes (sols agricoles ou forestiers, rhizosphère, phyllosphère,  milieux aquatiques,…), les digesteurs (microbiote intestinal  humain, systèmes digestifs animaux, systèmes agroindustriels ou de dépollution,…), les écosystèmes alimentaires (aliments et leurs microflores : produits laitiers, carnés, poissons, vin,…) et écosystèmes liés à la santé (pathosystèmes et pathosphères  environnementaux tels que ceux de l’air/aérosols, hôtes-vecteurs-agents pathogènes,…).

Contexte scientifique

Les microorganismes constituent environ 50% de la biomasse de l'ensemble de la biosphère et représentent des enjeux agronomiques majeurs dans les domaines suivants :

  • Agriculture et élevage,
  • Changement climatique global,
  • Santé humaine et animale,
  • Alimentation,
  • Production d’énergie renouvelable et de synthons, dépollution, traitements de déchets

Le développement des techniques de séquençage à très haut débit et la mise au point de nouveaux procédés méthodologiques permettent désormais de caractériser les microorganismes non cultivables au laboratoire. Il devient donc possible d'étudier, dans sa globalité, le contenu génétique d'un écosystème complexe. C'est l'objectif des approches méta-omiques.




Objectifs généraux du métaprogramme

  1. Créer une communauté scientifique pluridisciplinaire
  2. Contribuer à développer des pipelines et des méthodes d’analyses
  3. Dépasser progressivement les approches descriptives, développer la compréhension du fonctionnement des écosystèmes, leurs modélisations et pilotages
  4. Incuber et soutenir quelques projets pluridisciplinaires/intégrés en lien avec les groupes thématiques du métaprogramme
  5. Rendre visible et positionner à l’international nos grands domaines d’activité



Périmètre (Écosystèmes et Départements)

Périmètre du métaprogramme MEM. © inra, Emmanuelle MAGUIN
Périmètre du métaprogramme MEM © inra, Emmanuelle MAGUIN


Présentation du métaprogramme MEM en 4 pages

Consultez en ligne (ou téléchargez ci-dessous) le fichier PDF :

MP-MEM-Fr-validé_23juin2017_vf




Voir également : Les orientations stratégiques de l'Inra à l'horizon 2025